У нас пока что много закрытий обращений к БД по-своему.
Я на данный момент исправил
Course.java - было не закрыто соединение
batchSender/SolutionSender.java - было не закрыто соединение
/Analyzer/CGroupEd.java не вызывался getInstanse()
а также, нашел пока около 10-ти классов с подобными отклонениями, которые придется исправить...